نایب رئیس مجلس به فرمانده کل سپاه یادآور شد که تصمیم‌گیری در مورد مذاکره یا عدم مذاکره با آمریکا بر عهده سپاهیان نیست. محمد علی جعفری به تازگی گفته است که مردم ایران هرگز اجازه مذاکره با آمریکا را به مسئولان نمی‌دهند.علی مطهری در نامه‌ای خطاب به فرمانده کل سپاه پاسداران که خبرگزاری ایسنا متن آن را بامداد جمعه ۱۲ مرداد منتشر کرد به اظهارات او درباره اعلام آمادگی دونالد ترامپ برای مذاکره بدون پیش‌شرط با ایران واکنش نشان داد. نایب رئیس مجلس شورای اسلامی نامه به محمد علی جعفری را با نقل بخشی از اظهارات روز سه‌شنبه نهم مرداد او آغاز کرده که در آن خطاب به رئیس جمهور آمریکا گفته بود "مردم ایران هرگز به مسئولین خود اجازه مذاکره و ملاقات با شیطان بزرگ را نمی‌دهند" و این اتفاق نه در دوره ترامپ خواهد افتاد نه دوره روسای جمهوری بعدی ایالات متحده. به کانال دویچه وله فارسی در تلگرام بپیوندید مطهری خطاب به جعفری نوشته است: «جناب‌ عالی و سایر برادران مجاهد و خوب ما در سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در موضوعی مانند مذاکره یا عدم مذاکره با آمریکا باید تابع تصمیم مقامات عالی نظام باشید نه این که راساً به عنوان فرمانده کل سپاه اظهار نظر نمایید. علاوه بر این که اعلام چنین نظراتی به نمایندگی از ملت باید توسط نماینده و منتخب ملت یعنی رئیس‌جمهور انجام شود نه هر مقام. پرهیز از دخالت نظامیان در سیاست او با ذکر قولی از نخستین رهبر جمهوری اسلامی، آیت‌الله روح‌الله خمینی که نظامیان را از دخالت در سیاست منع کرده، یکی از معضلات ایران را "دخالت نهادها و مقامات مختلف در کار یکدیگر" عنوان کرد. نایب رئیس مجلس در بخش پایانی نامه خود به فرمانده سپاه نوشت: «اگر مجلس و دولت و قوه قضائیه و شوراهای عالی امنیت ملی و انقلاب فرهنگی و فضای مجازی و نیروهای مسلح و مجمع تشخیص مصلحت نظام و مجلس خبرگان رهبری و شورای نگهبان هر یک کار خود را درست انجام دهند و وارد حوزه دیگر نشوند وضع کشور سامان بهتری می‌یابد.» به گزارش خبرگزاری فارس، فرمانده کل سپاه پاسداران چند روز پیش در واکنش به پیشنهاد مذاکره بدون پیش‌شرط ترامپ خطاب به او گفته است: «شما این آرزو را به گور خواهید برد که مقامات جمهوری اسلامی ایران از شما درخواست ملاقات کنند یا اجازه ملاقات با شما را از ملت‌شان دریافت نمایند. هرگز چنین روزی را نخواهید دید.» علی مطهری پیش از این نیز در سخنان کم‌سابقه‌ای بدون نام بردن از سپاه پاسداران، نظامیان تحت فرماندهی رهبر جمهوری اسلامی، علی خامنه‌ای را عامل اصلی ناکامی توافق هسته‌ای و اجرای برنامه جامع اقدام مشترک (برجام) معرفی کرد. انتقاد از موشک هوا کردن سپاه به گزارش خبرگزاری ایسنا، نایب رئیس مجلس نهم مرداد در جمع خبرنگاران گفت: «مسئول وضعیت جاری کشور آنهایی هستند که با هوا کردن موشک تلاش کردند برجام اجرا نشود که البته به هدفشان هم رسیدند.» برنامه‌های موشکی مناقشه‌برانگیز سپاه یکی از علت‌های خروج آمریکا از توافق هسته‌ای و برجام عنوان شده که ترامپ فرمان اجرایی آن را هشتم ماه مه (۱۸ اردیبهشت) امضا کرد. سپاه این برنامه‌ها را از دستاوردهای افتخارآمیز خود می‌داند و علی خامنه‌ای با هر گونه مذاکره بر سر آن مخالفت می‌کند. مطهری در جمع خبرنگاران گفته بود که "بخشی از حکومت" ار ابتدا مایل به اجرای برجام نبود و "بالاخره به هدفش هم رسید". در حالی که برخی از حامیان دولت نظیر علی اکبر ناطق نوری، عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام معتقدند که نباید "ابتدا به ساکن" پیشنهاد مذاکره مستقیم ترامپ را رد کرد و شماری از مشاوران رئیس جمهوری شرط مذاکره را بازگشت آمریکا به برجام عنوان کرده‌اند، تا کنون رهبر جمهوری اسلامی درباره پیشنهاد دونالد ترامپ سخنی نگفته است.